棉纖維上的含氮物質主要存在于纖維胞腔內的原生質中,在初生胞壁和次生胞壁中也有。含氮物質中60%以上都是以蛋白質的形態存在,另一部分以較簡單的化合物(如硝酸鹽和亞硝酸鹽等)存在。棉纖維中的含氮物質與果膠質一樣,凡是成熟度越高的棉纖維,含氮物質的含量越低。一般棉纖維的含氮物質為0.2%～0.44%。棉纖維上的含氮物質能在服用中逐漸促使織物泛黃,因此應予以去除。
棉纖維上的含氮物質能與濃硝酸發生朊黃色反應,經氨作用后轉為橙色,這說明棉纖維上的含氮物質可能含有三種環狀氨基酸,即苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸。
棉纖維上含氮物質的一小部分(約占15%～17%)在60℃水浴中處理1h就能除去,但大部分不易去除,用濃度為10g/L的氫氧化鈉溶液沸煮8h可去除約74%,用50g/L的氫氧化鈉溶液沸煮8h也只能脫除88.8%。酒精和苯在加熱條件下也能降低棉纖維上含氮物質的含量。但用次氯酸鈉處理,能夠基本上(約96%)去除棉纖維上的含氮物質。去除的機理是次氯酸鈉與蛋白質相互作用時,能發生多縮氨酸鍵的斷裂,生成一系列的氯氨基酸,氯氨基酸又因過剩的堿而轉化成可溶性的鈉鹽。此外,用蛋白酶處理棉纖維也能脫除含氮物質.
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